Anotación funcional de genes de cepas de algas

El servicio se refiere al análisis computacional de genomas y transcriptomas de organismos de interés. La contraparte proporcionará las secuencias, que pueden ser genomas parciales o completos, transcriptomas, proteomas, nombre de la proteína o actividad a buscar (son datos, que no incluyen material genético) de especies de microalgas.

Metodología

Para el análisis de datos se utilizarán herramientas disponibles online o descargables, que predicen similitud, identidad y probable función de genes y/o proteínas.

Preguntas frecuentes

¿Qué tipos de genes/proteínas se pueden analizar?
Podemos analizar cualquier proteína, familia o superfamilia de proteínas. Incluso podemos analizar proteínas con determinado dominio, motivo o actividad catalítica. Podemos analizar a nivel de gen, ARN mensajero o proteína.

¿Qué datos es necesario que la contraparte proporcione para que se realice el servicio?
Dependiendo de la necesidad, se puede proporcionar una secuencia génica o proteica, el nombre de un gen o proteína (incluídos nombres de dominios o motivos) o un tipo de actividad catalítica.

¿Qué información proporciona el servicio acerca del gen o proteína de interés?
Esto depende del interés de la contraparte. Entre otros servicios, podemos proveer:
- Secuencias génicas o proteicas, arquitectura génica o análisis de motivos y dominios dentro de las proteínas.
- Secuencias de ARN, características predichas en los mismos (posible promotor, 5'y 3' UTRs, iniciación de la traducción, etc).
- Análisis de alelos, mutaciones o sintenia.
- Estructura predicha, posible función catalítica, análisis de hidrofobicidad, dominios de transmembrana, posible localización subcelular y otras predicciones estructurales y/o funcionales.
- Relaciones filogenéticas y análisis pangenómicos.
- Otros (consultar).

¿Con qué demora se envían los resultados de los análisis?
Esto va a depender marcadamente del tipo, cantidad y complejidad de los análisis. Escribinos con tu consulta y te respondemos a la brevedad.

Responsable Técnica

Dra. María Victoria Beligni
2236167656
mbeligni@gmail.com