En el IIB se llevan a cabo proyectos de investigación básica y aplicada, estos últimos enfocados en núcleos socio productivo-estratégicos (NSPE) identificados en el plan Argentina Innovadora 2030, tanto en el sector agroindustrial como en el área de la salud. Las tareas de investigación están estructuradas a través proyectos que se desarrollan en grupos de investigación que mantienen fuertes lazos con otros grupos o investigadores, tanto del IIB, como del ámbito nacional e internacional.

El IIB cuenta con 9 grupos de investigación que poseen un/a director/a y un/a codirector/a, investigadores/as de carrera, becarios/as doctorales y post-doctorales y pasantes. Estos son: